Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 HLA-DRA-201ENST00000374982 1169 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL450384.2-202ENST00000436485 656 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC012494.1-201ENST00000439259 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 ASS1P4-201ENST00000439462 1234 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL136088.1-201ENST00000531002 541 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC115676.1-201ENST00000538416 329 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC138761.2-201ENST00000583878 343 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSG10P-202ENST00000597171 1283 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL133520.1-201ENST00000610430 700 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 EXOC4-201ENST00000253861 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 OR14I1-201ENST00000342623 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 U3.48-201ENST00000363172 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL133343.1-201ENST00000375670 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 SSX6-201ENST00000376932 562 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPL4P4-201ENST00000422486 1284 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 HSD3BP5-201ENST00000434856 1132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 Z98747.1-201ENST00000438791 356 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL136452.1-201ENST00000448495 439 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSSK1A-201ENST00000450724 768 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL591866.1-201ENST00000456162 401 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPS14P7-201ENST00000473701 448 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1orf112-208ENST00000496973 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC02403-201ENST00000548215 484 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 EIF4EBP2P2-201ENST00000563883 333 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC105275.2-201ENST00000567907 711 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC073911.1-201ENST00000592296 504 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 UBE2U-206ENST00000611228 1550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFIB-205ENST00000380959 8198 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms