Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC073525.1-203ENST00000547040 2631 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 C4BPB-201ENST00000243611 1117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SNORA73A-201ENST00000364938 206 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MOSPD1-201ENST00000370777 784 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RPS24-202ENST00000372360 510 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TRIB2-203ENST00000405331 830 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TMEM139-202ENST00000409102 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC008937.2-201ENST00000415589 619 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AF127577.3-201ENST00000430391 781 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CYP4F26P-202ENST00000433357 852 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC104695.1-201ENST00000439700 849 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL451081.2-201ENST00000448115 933 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RPS27P12-201ENST00000464146 258 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RN7SL218P-201ENST00000464637 299 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02016-201ENST00000488425 927 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC01411-204ENST00000510234 938 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ARL1-203ENST00000539055 1231 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC009997.1-201ENST00000557862 129 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC087286.4-201ENST00000558757 746 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC011509.2-201ENST00000592263 627 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF257-207ENST00000600162 817 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CARSP1-201ENST00000603171 889 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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PDCD1Q15116 AC005034.2-201ENST00000604464 414 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RNF219-AS1-213ENST00000607860 577 ntTSL 4 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 5_8S_rRNA.2-201ENST00000612732 151 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MIR6872-201ENST00000612981 62 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02391-201ENST00000615716 800 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL390882.1-201ENST00000618821 594 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AL157359.3-201ENST00000623771 217 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
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PDCD1Q15116 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 STRADA-246ENST00000640397 1045 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RAD51B-211ENST00000487861 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC00506-203ENST00000629295 4300 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC008498.2-201ENST00000624033 2322 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LDHB-201ENST00000350669 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FBXO36-201ENST00000283946 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 KCTD6-201ENST00000355076 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 RAD9B-207ENST00000409778 1373 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 DCAF4L2-201ENST00000319675 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 MFSD8-207ENST00000513559 1813 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 LNPK-201ENST00000272748 7610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 PACRG-201ENST00000337019 1619 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ABCA9-207ENST00000495634 1428 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 FAM114A1-201ENST00000358869 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PDCD1Q15116 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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