Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ELF5-201ENST00000257832 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 GRIA4-212ENST00000530497 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NUMB-214ENST00000555238 3588 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PLGLB2-201ENST00000359481 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TRBV6-6-201ENST00000390371 388 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMEM213-201ENST00000397602 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC004009.1-201ENST00000412413 567 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR10J1-201ENST00000423932 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MRPL22-202ENST00000439747 784 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MED28P8-201ENST00000454831 521 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RN7SL201P-201ENST00000482306 296 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMEM106C-219ENST00000552546 742 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FLJ21408-204ENST00000566854 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL391807.1-201ENST00000603261 712 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC026950.2-201ENST00000633456 470 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL583859.2-201ENST00000634462 1127 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MIR548A1HG-202ENST00000637804 784 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC022784.6-204ENST00000520390 3442 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 IFT43-201ENST00000238628 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RFKP1-201ENST00000400940 428 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 C14orf2-202ENST00000414262 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LINC00665-202ENST00000427868 690 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RNF216-IT1-201ENST00000443837 337 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC239798.1-201ENST00000449024 1176 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC092570.2-201ENST00000452117 1143 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SERPINB5-205ENST00000489441 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC079313.2-201ENST00000550474 564 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC009269.2-201ENST00000559892 474 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TTN-AS1-210ENST00000578746 677 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC243772.3-202ENST00000609662 1148 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PROX1-AS1-221ENST00000615085 673 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC241585.4-201ENST00000640951 686 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 OR13D1-202ENST00000641530 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CLCN3-202ENST00000360642 3208 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ITM2A-202ENST00000434584 1698 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 ATP9B-208ENST00000586722 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 RBM46-201ENST00000281722 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
PDK4Q16654 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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