Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL353052.2-201ENST00000441459 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL355103.1-201ENST00000557246 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ELAVL2-203ENST00000380117 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC00955-202ENST00000514422 1502 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 WDR31-203ENST00000374195 3101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NRG3-206ENST00000545131 2713 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SORCS1-202ENST00000344440 3009 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR2T4-201ENST00000366473 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR2T4-202ENST00000366475 1047 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TRBV6-1-201ENST00000390353 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01799-201ENST00000411701 386 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ETF1P1-206ENST00000427296 984 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TBL1YP1-201ENST00000440297 1026 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SFTPA3P-201ENST00000446429 367 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL109945.1-201ENST00000448134 687 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AF127936.2-201ENST00000455253 1724 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC095050.1-201ENST00000502661 905 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TMEM150C-203ENST00000508701 566 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GAPDHP44-201ENST00000513513 1007 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC100849.1-202ENST00000517949 562 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PSAT1P1-201ENST00000518968 1106 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 IGKV2D-14-201ENST00000522473 355 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01499-201ENST00000528720 553 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PTPN14-205ENST00000543945 3842 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PPP2R5C-218ENST00000556260 2013 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC099508.2-201ENST00000563098 510 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ANP32BP1-201ENST00000564205 1297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SRP68P1-201ENST00000584247 269 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC087393.3-201ENST00000584971 166 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC007998.3-202ENST00000591141 697 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PROX1-AS1-208ENST00000601335 691 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 IRAK4-214ENST00000613694 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LMO3-204ENST00000354662 3574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 MAVS-202ENST00000428216 11714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NPL-203ENST00000367553 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CDY1B-202ENST00000382407 2227 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GULP1-203ENST00000409609 1932 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC092718.7-201ENST00000623577 1776 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 NAALAD2-204ENST00000525171 1613 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TDGF1P3-202ENST00000602699 2710 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC104964.2-201ENST00000562242 4641 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 LRP4-AS1-201ENST00000502049 1504 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 TTTY25P-201ENST00000558356 1505 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 STX2-203ENST00000392373 2151 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AL137782.1-201ENST00000563635 4128 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PDCD1Q15116 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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