Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 FHL1-227ENST00000628568 2304 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PROM1-210ENST00000510224 4006 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OR10K2-202ENST00000641042 3023 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OLR1-201ENST00000309539 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TIAL1-205ENST00000436547 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AP000705.2-201ENST00000433524 1386 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 C5orf63-201ENST00000296662 966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.2-201ENST00000359385 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ATF3-204ENST00000366983 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SRI-202ENST00000394641 653 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PPIAP2-201ENST00000414143 492 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OSBPL10-AS1-204ENST00000436598 513 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 FGF12-206ENST00000450716 768 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC104389.2-201ENST00000450768 887 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC02057-201ENST00000503882 640 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LNX1-AS2-202ENST00000509974 628 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC006499.1-201ENST00000511870 850 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC02162-201ENST00000512521 574 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01944-201ENST00000517916 416 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC110741.1-201ENST00000520149 582 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CA1-219ENST00000523022 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF503-AS1-205ENST00000530606 549 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CRTC3-AS1-201ENST00000558105 502 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TMX3-204ENST00000562706 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AP001020.1-201ENST00000579595 464 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF561-AS1-208ENST00000592851 782 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01198-208ENST00000599175 560 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL731556.2-201ENST00000615610 770 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL109954.1-201ENST00000619495 557 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC244517.10-201ENST00000624396 548 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CU638689.4-203ENST00000625185 785 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 FLII-230ENST00000628188 156 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CASC19-208ENST00000641056 1292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CASC19-227ENST00000641411 1285 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PPP2R5C-205ENST00000445439 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 GABRR3-203ENST00000621172 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CBR4-201ENST00000306193 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CETN2-201ENST00000370277 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CDC40-203ENST00000368932 3933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC106882.1-201ENST00000515789 2371 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 BDNF-AS-201ENST00000499008 2324 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 FCGR3B-204ENST00000531221 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms