Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 U3.31-201ENST00000408113 216 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AL358942.1-201ENST00000418595 1178 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 GAPDHP51-201ENST00000426454 1000 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC012494.1-201ENST00000439259 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC009108.1-201ENST00000473913 796 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC114786.3-201ENST00000509304 705 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 NTAN1P2-201ENST00000515730 940 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC244090.2-201ENST00000567614 792 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC244196.3-201ENST00000614171 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 NUDT13-208ENST00000617744 928 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 MIR193BHG-210ENST00000641327 515 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CFAP61-210ENST00000451767 1946 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 C1orf132-203ENST00000608023 15145 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CASP12-201ENST00000375726 1306 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 TMX2-201ENST00000278422 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CXCR4-202ENST00000409817 1895 ntAPPRIS P3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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SCN2BO60939 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 CCDC125-201ENST00000383374 2006 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SCN2BO60939 TROVE2-201ENST00000367441 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
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