Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 TAC1-203ENST00000350485 975 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 TRBV5-3-201ENST00000390362 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 TRAV17-201ENST00000390445 484 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RBMY2GP-201ENST00000418671 1034 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RBMY2NP-201ENST00000434454 1028 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC003991.2-201ENST00000520993 576 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 STH-201ENST00000537309 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC092142.1-202ENST00000567021 829 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC008759.2-201ENST00000585880 600 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC012301.1-201ENST00000586391 581 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC008770.1-206ENST00000589551 523 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTGFRP43088 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC114786.2-201ENST00000510090 1426 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PIWIL2-205ENST00000611073 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PSG9-203ENST00000291752 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PPIH-201ENST00000304979 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL450313.1-201ENST00000366376 452 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AP001342.1-201ENST00000423389 525 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 PTCSC2-201ENST00000430058 204 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL512366.1-201ENST00000438919 636 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC034238.2-201ENST00000445660 567 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC092569.1-201ENST00000455192 258 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RN7SL65P-201ENST00000485221 315 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC091820.2-201ENST00000521697 523 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AF279873.3-204ENST00000523336 784 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL160314.2-202ENST00000553792 534 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC005230.1-201ENST00000555418 285 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC138035.1-203ENST00000604354 1066 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AL132821.1-201ENST00000616029 394 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 LINC02086-204ENST00000628006 786 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTGFRP43088 AMZ2-210ENST00000580753 1339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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