Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCOA3Q9Y6Q9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms