Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHBDD3Q9Y3P4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHBDD3Q9Y3P4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms