Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMED7Q9Y3B3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms