Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y315

DERA, Deoxyribose-phosphate aldolase, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERAQ9Y315 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DERAQ9Y315 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DERAQ9Y315 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms