Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NOP58Q9Y2X3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOP58Q9Y2X3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms