Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC8Q9Y2L5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms