Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NINLQ9Y2I6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NINLQ9Y2I6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms