Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KCNH4Q9UQ05 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNH4Q9UQ05 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms