Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AGTPBP1Q9UPW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms