Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRAK1Q9UPV9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms