Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PTPRQQ9UMZ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRQQ9UMZ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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