Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
INO80Q9ULG1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
INO80Q9ULG1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms