Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RABGEF1Q9UJ41 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RABGEF1Q9UJ41 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RABGEF1Q9UJ41 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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RABGEF1Q9UJ41 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1Q9UJ41 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1Q9UJ41 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1Q9UJ41 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RABGEF1Q9UJ41 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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RABGEF1Q9UJ41 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RABGEF1Q9UJ41 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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