Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DUSP13Q9UII6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DUSP13Q9UII6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms