Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2IRD1Q9UHL9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2IRD1Q9UHL9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms