Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IFT172Q9UG01 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IFT172Q9UG01 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms