Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NXF1Q9UBU9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NXF1Q9UBU9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms