Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGSF9Q9P2J2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IGSF9Q9P2J2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms