Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP35Q9P2H5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP35Q9P2H5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms