Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E3

ZNFX1, NFX1-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNFX1Q9P2E3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNFX1Q9P2E3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNFX1Q9P2E3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.6 ms