Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABI3Q9P2A4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ABI3Q9P2A4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms