Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC41.51■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC41.44■■■■■ 4.23
CCDC180Q9P1Z9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC41.38■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.22
CCDC180Q9P1Z9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.21
CCDC180Q9P1Z9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms