Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GDE1Q9NZC3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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