Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCM9Q9NXL9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms