Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM28Q9NW13 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM28Q9NW13 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms