Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DNAJC17Q9NVM6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DNAJC17Q9NVM6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms