Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPTLC3Q9NUV7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms