Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PDS5BQ9NTI5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.14
PDS5BQ9NTI5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PDS5BQ9NTI5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms