Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PKDREJQ9NTG1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PKDREJQ9NTG1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms