Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NDUFA4L2Q9NRX3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms