Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBQLN4Q9NRR5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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