Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms