Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DUOX1Q9NRD9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DUOX1Q9NRD9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms