Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C8orf4Q9NR00 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms