Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RTN4Q9NQC3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms