Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms