Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LHX9Q9NQ69 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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LHX9Q9NQ69 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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LHX9Q9NQ69 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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