Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VTA1Q9NP79 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VTA1Q9NP79 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms