Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFGAP3Q9NP61 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms