Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG7

GBA2, Non-lysosomal glucosylceramidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBA2Q9HCG7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBA2Q9HCG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBA2Q9HCG7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms