Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CBX8Q9HC52 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms