Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
APOBEC3GQ9HC16 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms