Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR7

DDX24, ATP-dependent RNA helicase DDX24, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX24Q9GZR7 MELK-213ENST00000626154 1966 ntTSL 212.67□□□□□ -0.384e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-205ENST00000495529 794 ntTSL 512.24□□□□□ -0.454e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-214ENST00000627766 2263 ntTSL 511.32□□□□□ -0.64e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-206ENST00000536329 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.754e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.044e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.144e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.154e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.324e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 NRBP2-206ENST00000530347 1037 ntTSL 523.38■■□□□ 1.339e-9■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 519.48■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.816e-7■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.536e-7■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 TJP2-211ENST00000636247 3725 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -06e-7■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 23.6
DDX24Q9GZR7 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 315.37■□□□□ 0.056e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 PRSS21-209ENST00000575739 378 ntTSL 310.67□□□□□ -0.76e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 DIP2B-203ENST00000546732 3514 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.078e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 BRSK1-208ENST00000592539 545 ntTSL 514.25□□□□□ -0.138e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HDAC7-221ENST00000477203 3122 ntTSL 215.82■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.163e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MIGA2-203ENST00000439290 4345 ntTSL 215.66■□□□□ 0.17e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MIGA2-204ENST00000445183 3598 ntTSL 215.1■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.125e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.085e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.955e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 MLXIP-205ENST00000535876 465 ntTSL 218.87■□□□□ 0.616e-15■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.555e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.255e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.185e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.825e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.615e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.615e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.59e-8■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CPNE1-225ENST00000483495 1853 ntTSL 515.8■□□□□ 0.123e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 EZH1-209ENST00000586382 1022 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.128e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.049e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 DNM1-204ENST00000441149 3286 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CAD-211ENST00000491891 662 ntTSL 313.65□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 KRBA1-203ENST00000485033 3434 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 KRBA1-207ENST00000496259 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 LTBP4-238ENST00000622457 547 ntTSL 214.29□□□□□ -0.126e-11■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.249e-8■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 ISYNA1-214ENST00000583816 860 ntTSL 317.73■□□□□ 0.431e-9■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.47e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.297e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HERC2-207ENST00000564734 3121 ntTSL 1 (best)17.81■□□□□ 0.448e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 FASN-204ENST00000580382 681 ntTSL 320.96■□□□□ 0.951e-17■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.74e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.444e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-213ENST00000475890 2080 ntTSL 517.65■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.334e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-204ENST00000379850 2379 ntTSL 515.35■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 LLGL2-211ENST00000578638 2367 ntTSL 219.85■□□□□ 0.772e-6■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 HEMK1-204ENST00000443894 634 ntTSL 318.58■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 23.5
DDX24Q9GZR7 CPNE7-205ENST00000529800 519 ntTSL 512.05□□□□□ -0.485e-10■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 NUP214-203ENST00000451030 5021 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.362e-14■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 MIGA2-210ENST00000483458 2532 ntTSL 220.78■□□□□ 0.921e-6■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 MAN2A2-215ENST00000559704 449 ntTSL 35.44□□□□□ -1.541e-18■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 CA8-203ENST00000528666 510 ntTSL 39.46□□□□□ -0.96e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 RIPOR3-206ENST00000488529 953 ntTSL 520.4■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-6■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-8■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.957e-8■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.994e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 APEH-201ENST00000296456 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 NRBP2-204ENST00000529747 3693 ntTSL 219.43■□□□□ 0.71e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 LRBA-210ENST00000510841 2288 ntTSL 219.17■□□□□ 0.667e-8■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 LRBA-212ENST00000514435 2140 ntTSL 217.44■□□□□ 0.387e-8■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 ULK1-202ENST00000537421 959 ntTSL 315.13■□□□□ 0.015e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 GRIPAP1-211ENST00000619107 904 ntTSL 515.75■□□□□ 0.114e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.671e-12■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.861e-12■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.256e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 KIAA0100-211ENST00000581064 555 ntTSL 213.51□□□□□ -0.253e-9■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 427.43■■□□□ 1.987e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 227.43■■□□□ 1.987e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 525.7■■□□□ 1.77e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 425.7■■□□□ 1.77e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 525.34■■□□□ 1.657e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 222.22■■□□□ 1.157e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 FNDC3B-212ENST00000494000 2600 ntTSL 1 (best)8□□□□□ -1.137e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 222.1■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 ASL-206ENST00000464970 640 ntTSL 319.02■□□□□ 0.646e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 ASL-208ENST00000488343 198 ntTSL 318.97■□□□□ 0.636e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.676e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.586e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.386e-7■■■■□ 23.4
DDX24Q9GZR7 MACROD1-204ENST00000541041 230 ntTSL 315.76■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 23.4
Retrieved 100 of 28,409 protein–RNA pairs in 207.5 ms